Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ8

Vmn2r90, Vomeronasal 2, receptor 90, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r90E9PXJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r90E9PXJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r90E9PXJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r90E9PXJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r90E9PXJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r90E9PXJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r90E9PXJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms