Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl3lE9PWZ3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl3lE9PWZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl3lE9PWZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl3lE9PWZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl3lE9PWZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms