Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Scn3aA2ASI5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn3aA2ASI5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn3aA2ASI5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn3aA2ASI5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn3aA2ASI5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn3aA2ASI5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn3aA2ASI5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms