Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700025B11RikA0A087WNZ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700025B11RikA0A087WNZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700025B11RikA0A087WNZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms