Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX49Q9Y6V7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX49Q9Y6V7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms