Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP3Q9Y6F1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms