Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3Q9Y4A8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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