Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms