Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
THRAP3Q9Y2W1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
THRAP3Q9Y2W1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
THRAP3Q9Y2W1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
THRAP3Q9Y2W1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms