Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms