Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NINLQ9Y2I6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms