Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLEC11AQ9Y240 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC11AQ9Y240 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215 ms