Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms