Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms