Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms