Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIMS3Q9UJD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms