Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms