Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH4Q9UIA0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms