Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms