Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMPXQ9UHP9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMPXQ9UHP9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMPXQ9UHP9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms