Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms