Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms