Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms