Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms