Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms