Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC180Q9P1Z9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms