Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNKQ9P0W0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms