Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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TMOD3Q9NYL9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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TMOD3Q9NYL9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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TMOD3Q9NYL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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