Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms