Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCC13Q9NSE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms