Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms