Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms