Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOX1Q9NRD9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms