Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDH12Q9NPG4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCDH12Q9NPG4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms