Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGRNQ9NPE2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms