Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms