Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F12Q9HCS2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms