Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms