Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms