Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCIF1Q9H4Z3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms