Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms