Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms