Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNMDQ9H2S6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms