Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms