Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN1Q9GZU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms