Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms