Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNPKQ9C0E8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms