Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms