Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms