Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms